Tenemos una aplicación que funciona con .Net Framework 3.5 después de instalar la versión 2 y actualizar a la 4 este dichoso programita del cual no quiero acordarme muestra un amable mensaje que necesito la instalación de la versión 3.5 así que nos bajamos la instalación de la 3.5 Full de forma que no se descargue online este seria el enlace oficial de la pagina de Microsoft.

Bien después de lanzar la instalación recibo el siguiente error.

[02/08/13,17:11:42] Microsoft .NET Framework 2.0a: [2] Error: Installation failed for component Microsoft .NET Framework 2.0a. MSI returned error code 1603[02/08/13,17:12:09] WapUI: [2] DepCheck indicates Microsoft .NET Framework 2.0a is not installed.

Así que ha probar soluciones la primera y que tenia muy buena pinta fue limpiar archivos temporales, dándole a inicio -> ejecutar -> %temp% y borrar todo lo de dentro, seguido me bajo el programa para eliminar todas las versiones de .net, Cleanup tool.

Pero sin mucha fortuna también encontré en programamandoenpunto net que cambiáramos la entrada del registro 

HKEY_LOCAL_MACHINE\Software\Policies\Microsoft\Windows\Safer\CodeIdentifiers

Cambie el valor del Registro PolicyScope. Para ello, haga doble clic en PolicyScope y, a continuación, cambie la configuración de 0 a 1.

Pero nada se resistía, así que desde agregar o quitar programas elimine una a una todas las instalaciones de .net que aun aparecían y después de unos reinicios y seguramente la combinación de todo lo de arriba funciono perfectamente.